清算組織正式成立后，公司即開始進入實質(zhì)性清算程序。具體包括：

　　(一)清理公司財產(chǎn)，分別編制資產(chǎn)負(fù)債表和財產(chǎn)清單。清算組織要全面清理公司的全部財產(chǎn)，不僅包括固定資產(chǎn)，還要流動資產(chǎn);不僅包括有形資產(chǎn)，還包括無形資產(chǎn);不僅包括債權(quán)，還包括債務(wù)。在清理后，清算組需要編制資產(chǎn)負(fù)債表和財產(chǎn)清單，作為下一步工作的基礎(chǔ)。

　　(二)通知、公告?zhèn)鶛?quán)人并進行債權(quán)登記。清算組應(yīng)當(dāng)自成立之日起十日內(nèi)通知債權(quán)人，并于六十日內(nèi)在報紙上公告。債權(quán)人應(yīng)當(dāng)自接到通知書之日起三十日內(nèi)，未接到通知書的自公告之日起四十五日內(nèi)，向清算組申報其債權(quán)。債權(quán)人申報債權(quán)，應(yīng)當(dāng)說明債權(quán)的有關(guān)事項，并提供證明材料。清算組應(yīng)當(dāng)對債權(quán)進行登記。在申報債權(quán)期間，清算組不得對債權(quán)人進行清償。為了防止清算組對個別債權(quán)人進行優(yōu)先清償，新法增加規(guī)定了在債權(quán)申報期間，清算組不得對債權(quán)人進行清償?shù)姆ǘx務(wù)。

　　(三)提出財產(chǎn)估價和清算方案。清算組在清理公司財產(chǎn)、編制資產(chǎn)負(fù)債表和財產(chǎn)清單后，應(yīng)當(dāng)制定清算方案，提出收取債權(quán)和清償債務(wù)的具體安排，并報股東會、股東大會或者人民法院確認(rèn)。

　　(四)分配財產(chǎn)。清算的核心任務(wù)是分配財產(chǎn)。根據(jù)公司法第一百八十七條的規(guī)定，財產(chǎn)的分配順序依次為：(1)支付清算費用;(2)支付職工的工資、社會保險費用和法定補償金;(3)繳納所欠稅款;(4)清償公司債務(wù);(5)上述四項款項清償完畢之后的公司剩余財產(chǎn)，有限責(zé)任公司按照股東的出資比例分配，股份有限公司按照股東持有的股份比例分配。取得公司剩余財產(chǎn)的分配權(quán)，是公司股東自益權(quán)的一項重要內(nèi)容，是公司股東的基本權(quán)利。在分配方式上可采取貨幣分配、實物分配或者作價分配等形式，其基本要求是：既要最大限度保護股東的權(quán)益，又要體現(xiàn)平等和公平分配的原則。清算期間，公司存續(xù)，但不得開展與清算無關(guān)的經(jīng)營活動。公司財產(chǎn)在未按照上述規(guī)定清償前，不得分配給股東。